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更新時(shí)間：2021-02-08
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nanoporetech 使用納米孔測(cè)序技術(shù)的微生物學(xué)
完整的細(xì)菌，真菌和病毒（DNA或RNA）基因組，可進(jìn)行長(zhǎng)時(shí)間的納米孔測(cè)序。通過快速的病原體檢測(cè)方法（無論是在實(shí)驗(yàn)室還是在野外），從環(huán)境或單一生物樣品中鑒定并鑒定微生物。如果需要，還應(yīng)附有抗菌素耐藥性分析。使用直接RNA或cDNA方法對(duì)全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄本進(jìn)行測(cè)序，以進(jìn)行準(zhǔn)確的基因表達(dá)和轉(zhuǎn)錄本亞型分析。
全面分析微生物基因組（DNA或RNA）。準(zhǔn)確定位重復(fù)區(qū)域和結(jié)構(gòu)變異，并使用長(zhǎng)測(cè)序讀數(shù)將質(zhì)粒與基因組區(qū)分開。簡(jiǎn)化從頭組裝并更正現(xiàn)有的參考基因組?？蓴U(kuò)展以適應(yīng)您從工作臺(tái)到現(xiàn)場(chǎng)的需求。
實(shí)時(shí)準(zhǔn)確識(shí)別微生物和相關(guān)的抗藥性（AMR）。Oxford Nanopore提供了完整的解決方案-從快速的10分鐘文庫制備（DNA）到使用EPI2ME平臺(tái)的實(shí)時(shí)系統(tǒng)發(fā)育和AMR分析。使用宏基因組或靶向16S rRNA方法。使用便攜式MinION或臺(tái)式GridION或PromethION設(shè)備在樣品源處或?qū)嶒?yàn)室中進(jìn)行測(cè)序。
使用全長(zhǎng)納米孔測(cè)序讀數(shù)，解析轉(zhuǎn)錄本亞型并測(cè)量真實(shí)的基因表達(dá)譜。低投入量與快速，簡(jiǎn)化的工作流程相結(jié)合，可進(jìn)行高度敏感的基因表達(dá)分析
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微生物表現(xiàn)出許多類型的堿基修飾，可影響一系列功能，包括基因表達(dá)和抗菌素耐藥性。與基于替代測(cè)序的分析方法不同，納米孔測(cè)序不需要擴(kuò)增或鏈合成，可以減少偏差并保留修飾的堿基信息，這些信息可以與核苷酸序列一起直接檢測(cè)到-無需額外的樣品轉(zhuǎn)換。
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